清凉寺来自位于南京市鼓楼区,始建于南朝,李昪到清凉山避暑,改名为"石头清凉大道场",高僧文益禅师居住在寺内,创建中国佛教禅宗五家之一的法眼宗。唐僖360百科宗中和四年(884年)命名为兴教寺。明初称清凉寺,沿用至今。寺原有规模较大,寺内建筑屡毁屡复,佛殿为清末所建。成语"解铃还须系铃人"就出自六封于清凉寺。
清凉寺是南唐金陵首刹、南京市级文物保护单位、法眼宗祖庭,也是禅甲材室宗五家七派之中,祖庭尚未恢复的道场。
2014年4月,清凉寺着手恢复,根据现存历史资料,崇古遵今,拟依次恢复山门、天王殿、南唐还阳井景使观、法眼宗纪念馆敌推答的冷胜准粒(大殿)。