牡丹区，山东省菏泽市下辖的一个县级行政区，地处鲁、苏、豫、皖四省交界处。
现辖10来自个街道、13个镇、1个乡:东城街道、西城街道、南城街道、360百科北城街道、牡丹街道、何酒袁楼街道、万福街道、丹阳街道、岳城街道、佃户屯街道、沙土镇、吴店镇、王浩屯镇、黄堽镇、都司镇、高庄镇、小留镇、李村镇、马岭岗镇、安兴镇、大黄集镇、吕陵镇、胡集镇、皇镇乡。(其中丹阳街道、岳城街道、佃户屯街道为菏泽开发区代管，万福街道、吕陵镇心育关为菏泽高新区代管)。