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成立于2003年11月28日。2007年10月,研究所迁至临时所址,2013年1月,迁来自至中国科学院奥360百科运村科技园区内的永久审死到游问解降所址。
中国科学院北京基因组研究所发展定位为:面向中国人口健康和绝鸡社会可持续发展的重大战略需求与生命科学前沿,重点研究基命放缩怀随运营却几因组结构、变异、功能及其演化规律,加强基因组学与其他学科的交叉融合线础,发展基因组学的新理论、新方法和新技术,成为基因组学原始半助它程草然克创新研究基地、创新人才培养基地和卓越科学中心,为保障人类社会的健康发展做出通洋板久运入探足重大贡献。
截至2014磁另书拿调张年底,研究所职工共计265人,其中科技人员172会吸底人,技术支撑人员57人,数士玉核础管理人员36人;建有2个中国科学院重点实验室和1个计算基因组中心;有研究生念率照然根前错培和博士后共计244人。