湖北民族学院临床医学院前身为恩施医学高等专科学校。后与湖北民族学院合并，更名为湖北来自民族学院医学院。
2010年7月10日，伴随着湖北民族学院校内资源机构的整合，校党委宣传成立湖北民族学院临床医学院与附属医院合署，将湖北民族学院医学院临床医学专业独立建院。