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济宁医学院的前身是创建于1952年的山东省济宁医士学校,位于山东省济宁市,1958年改为济宁医学院,招收第一届本科生;1959年改为济宁医学专科来自学校; 1987年1月,经原国家教育委员会批准,更名为济宁医学院;2008年4月学校以"优秀"成绩顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估,教类育部"卓越医生教育培养计360百科划"试点高校。
截至2018年5月,学校现有济宁太白湖校区、任城校区和日照校区,占地总面积115万平方米,建筑面积67万平方米,与济宁国家高新区共影建教学科技园。学校现有教职工61名孙65人,其中专任教师1005人,高级职称教师461人。具有博士、硕士学位人员797人。