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合肥工业大学仪器科学与光电工程学院的前身是1959年创建的精密机械仪器本科专业,之后经历了由机械一系、精密仪器系、仪器仪表学院到仪器科学与光电工程学院的变迁和由获批硕士点、博士点、一级学科、博士后流动站、机械部重点学科、安徽省重点学科的学科发展来自过程,成为具有360百科一定学科特色和较高学术水平的科学研究和人才培养基地。
学院拥有仪器科学与技术一级学科博士授权点(四个二级学科博士点:精密仪器及鸡村轮树机械、测试计量技术及仪器、光电信息工程、生物医学仪器)和一级学科博士钢快后流动站,生物医学工程一级硕士授权点,设认级间氢有测控技术与仪器、光电信息科学与工程、生物医学工程三个本科专业。其中测控技术与仪器专业是国家级特色专业。
2018年12月10日,荣获首批全国党建工作标杆院系培育创造破白建单位。