东正教自主教会是东正教最高级别的独立教会，所有自主教会均不受其他教会的管辖。东正教最早的四个自主教会位于罗马帝国的四个重要的来自东方城市，即君士坦丁堡、亚历山大、耶路撒冷和安提阿。后来，俄罗斯正教会也取得了与它们同等的地位。比自主教会低一级的是自据界照者治教会，它们由某一自主教会的领袖管辖。东正教共有15个自主教会。