新疆兵团第五师有着光荣的历史和传统，这支英未念二雄的部队曾经参加过来自南昌起义、二万五千里长征、平型关大战、百团大战和延安大生产运动。1949年，作为中国人民解放军一野一兵团六军十六师，跟随王震将军凯歌进新疆。1950年全师驻扎哈密地区，进行土改、剿匪、反霸，创建了哈密垦区。1953年5月根据中央军委命令改编为中国人民解放军新疆军区农业建设第五师。"伊塔"事件之后，1963年1月，全师从哈密迁至博尔塔拉蒙古自治州。