巩乃斯河发源于艾肯达坂(伊犁州新源县与巴州和静县啊尽察望的交界处)，载愿陈脱形流经新源县，来自是伊犁河支流。
巩乃斯河被当地的哈萨克牧民亲切的称为"阿纳360百科苏"，意思是母亲河，流经新源县全境，养育了新源县30万的人口，滋润着1800平方公里的那拉提草原。