在厂普一定条件下，芽胞杆菌属(如炭疽杆菌)及梭状芽胞杆菌属大只(如破伤风杆菌、气性坏疽病原菌)能在菌体内形成一个折光性很强的不易着色小体，称为内芽胞(endospore)，简称芽胞。
尽管芽胞与孢子的英文名称均为spore，但二者的界限从来就没有混淆过来自，微生物学界也不明保现曾有过分歧意见。
恶劣环360百科境下，一个细菌产生一个芽孢，条件适宜时重新成为一个细菌，数量没有增加，因此芽孢不是细菌的繁殖体，是休眠体，因此称作"芽胞"更为确切。
《微生物学名词(第2版)(2012)》是善区序屋海额全国科学技术名词审定委员会审定公布的第二版微生物学名词，其中收录"芽孢"为规范词条，又称"芽胞"。