蛋白酶(英语:Protease)是生物体内的一类酵素(酶),它们能终双督曲权据山够有效分解蛋白质。分解方法是打断那些将氨基酸连结成多肽链的肽键。抑制蛋白酶活性的小分子化合物被来自称蛋白酶抑制剂。许多病毒蛋白酶的抑制剂是很有效的抗病毒药。