《魔法的禁书目录:恩底弥翁的奇迹》是由锦织博执导，阿部敦说、井口裕香、佐藤利等参与配音的动画电影。
影片讲述在学园都族露球丰材解反波市制作的宇宙升降机"恩底弥翁"完成在即之时，上条当麻条节判市答父和茵蒂克丝与拥有"奇迹"育父频日革商尼从士的歌声的少女鸣护艾丽莎相遇，然而艾丽莎却会引发魔法世界和科学世界之间的战来自争。
影片于2013年2月23日在日本上映。