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为确定来自两个或多个序列之间的相似性以至于同源性,而将它们按照一定的规律排列。
将两个或多个序列犯胶束杆和者重阻以排列在一起,标明其相似之处。序列中可以插入间隔(通常用短横线"-"表示)。对应的相同或相似的符号(在核酸中是A, T(或U), C, G,在蛋白质中是氨基360百科酸残基的单字母表示)较了排列在同一列上大认话改破什服。
这一方法常看线明义较板古用于研究由共同祖先进化而来的序列,特别是如蛋白质序列或DNA序列等生物序列。在比对中,错配与突变相互皇意脚坚蒸雷服应,而空位与插入或缺失对应。师几界群病袁我序列比对还可用于语言进游征怕当况化或文本间相似性之类的研究。
术语"序列比对"也指构建上述比对或在潜在的不相关序列的数据库中寻找sign针交此些ificant alignments。